Los fondos de la Biblioteca Digital del Ateneo se agrupan las siguientes categorías: Libros y folletos: publicaciones del Ateneo (estatutos y reglamentos, listas de socios, memorias, catálogos de exposiciones), ediciones propias, historias del Ateneo y últimos donativos recibidos. Revistas (desde 1877 hasta 2003). Otras colecciones: Actas del Ateneo, Cartas manuscritas, Placas de positivos en cristal.